先天性房間隔缺損與其它先天性心臟疾病相同，均為先天缺陷，是患兒出生後具有的結構畸形。通過修復缺損畸形後，心臟的內皮細胞可形成正常內皮組織結構，因此小型的房間隔缺損可通過外科手術、介入治療，糾正隔缺損畸形，常規治療後不會復發。

部分患兒在手術後出現呼吸困難、煩躁不安、餵養困難時，無需擔心為先天性房間隔缺損的復發症狀。