繼發孔型房間隔缺損5mm，要根據患者情況進行治療，具體如下：

1、如果繼發孔型房間隔缺損5mm發生在嬰幼兒身上，這種情況往往不需要治療，因為5mm的缺損對於孩子的影響往往比較小，可以選擇觀察，在觀察的過程中，有一部分孩子可以出現房間隔缺損自愈的情況。因此，需要定期複查，如果房間隔缺損沒有明顯變化，可以擇期治療；

2、如果這種情況出現在成人身上或出現在年齡較大的孩子身上，房間隔缺損沒有自愈可能，可考慮行介入封堵治療或手術治療。