川崎病在3歲以下容易復發，復發的因素是上次感染時留有心臟方面的後遺症的。超過8歲如果沒有復發，那麼復發的可能性很小。這是一種自限性疾病，復發的幾率為1%~2%之間，假如沒有經過有效的治療，冠狀動脈瘤的發病率約在15%-20%之間，但是大多數動脈瘤在1-2年內時可以消失的。

即便病情穩定出院也要隨診，檢測各項化驗指標，根據病情緩慢停藥，防止復發。