川崎病本身是一種自限性疾病，大多數是預後良好的，所以對大多數川崎病患兒來說，是不影響以後的生活的。復發多見於1%-2%的患兒，無冠狀動脈患兒出院後1個月、3個月、6個月及1-2年進行1次全面檢查，包括體格檢查、心電圖、超聲心電圖等。未經有效治療的患兒15%-25%發生冠狀動脈瘤，應該長期的密切隨訪，每6-12個月1次。

另外冠狀動脈瘤多於病後2年內自行消失，但常遺留管壁增厚和彈性減弱等功能異常，大的動脈瘤，不宜完全消失，常形成血栓或者管腔狹窄。所以從這方面來說，對於少部分的孩子還是有一定的影響，關鍵是一定要複查。