部分川崎病患者症狀較輕可以自行痊癒，大概需要1周左右。典型川崎病患者住院1周左右就可以出院，沒有出現嚴重併發症都可以出院。部分嬰兒可能肝臟受累比較重，或有時候會用大劑量的阿司匹林，可能對肝功會有影響，若要進行保肝或做後期治療，時間會相對較長，多數患兒在7天左右可以好轉出院。

特別嚴重的患者，如出現嚴重併發症，住院時間會相應延長，或有冠脈問題，需要長期治療過程。但多數患兒在1周左右便可以痊癒出院，出院以後需要長期隨訪，甚至要3-5年，主要看冠脈有無問題。部分患兒早期時可能沒有冠脈問題，但在隨訪過程中，可以繼發冠脈問題，所以需要進行長期隨訪。如有巨大冠狀動脈瘤不易消失的，可能需要手術介入治療。