小兒川崎病即皮膚黏膜淋巴結綜合徵，其病因和發病機制目前尚不完全清楚，推測與下列因素有關：

1、感染因素，病原可能是多種，包括某些細菌，如葡萄球菌、鏈球菌、丙酸桿菌。某些病毒，如逆轉錄病毒，支原體、立克次體等。

2、非感染的因素，如有機汞中毒、洗滌液汙染或化學物品過敏等。

3、遺傳易感基因。認為是上述因素導致了小兒的急性免疫調節紊亂，觸發一系列由免疫介導的全身性血管炎性病變。