對於腦動脈瘤手術，尤其腦動脈瘤破裂並引起蛛網膜下腔出血後進行的動脈瘤開顱手術，有1/3的患者可能會出現不同程度的後遺症。對於出現後遺症的患者，僅少數與手術直接相關，多數患者是由於動脈瘤破裂以及後續腦血管痙攣、粘連性蛛網膜炎、腦積水等因素而引起後遺症。

後遺症會使患者出現一定程度的認知功能障礙、性格改變，可能影響日常生活與工作，還會出現肢體偏癱及偏身感覺障礙等。部分患者在手術後會出現反覆發作的癲癇，需長時間使用抗癲癇藥物進行控制。若患者出現正常的壓力性腦積水，需進行腦室-腹腔分流術。因此，腦動脈瘤破裂是神經外科的急危重症，會導致患者出現後遺症及合併症，而開顱手術作為治療動脈瘤的有效方式，在手術後也可能會遺留一定程度的後遺症與併發症。