肛裂是發生在肛門和直腸交界處，也稱齒線下方，即肛管皮膚部位，其實它並不深，扒開肛門口就能看到肛裂下端，在肛門鬆弛時可以看到全部肛裂，包括上段都能看到。

如果肛裂正在急劇的疼痛或者害怕疼痛者，由於肛門緊縮就不容易查到，不容易看到肛裂，但在排便動作時，肛裂充分暴露，這也是為什麼肛裂在排便時特別疼的原因，發生肛裂後一般人都感覺疼，所以醫生檢查肛裂時，需要專業知識和技術，不能反覆指診、下肛鏡，不能暴力操作，以免造成更大痛苦或者感染髮生在肛門周圍，發生肛門周圍膿腫。