隨著肺移植手術技術、供體保存和圍手術期處理的逐漸成熟，肺移植1年生存率，從過去70%提高到現在85%，但是遠期生存率無明顯升高，此提示肺移植所面臨的主要問題，受體和供體生物學不相容性。

在肺移植後的第一年裡，感染是死亡主要原因，受體對於細菌、真菌、病毒、寄生蟲存在的感染高風險，急性感染在移植後1年相對少見，移植1年後主要死因,共同存在。

慢性排斥、感染和其它併發症，肺移植術後生存時間，各種疾病各不相同，最長術後生存可達到20年，而術後3年生存率平均在50%-60%之間。