子宮內膜結核的治療主要分為三個方面：

1、一般治療：結核病通常是一種慢性消耗性疾病，在治療過程中應注意休息、避免勞累、增強營養、增強患者的抵抗力及免疫功能，也對治療有一定的作用。另外，治療期間應儘量避免性交；

2、抗結核藥物的治療：合理抗結核藥物治療是徹底治癒子宮內膜結核的重要辦法。常用的一線抗結核藥物與其它抗結核藥物相同，主要有異煙肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、鏈黴素等。但是子宮內膜結核治療的時間比單純的肺結核治療時間會長很多。需要患者樹立信心，不要隨意自行停藥，必須完成療程，才能做到真正的治癒；

3、手術治療：這類患者是少數，一般用於藥物治療效果不理想的患者，而且手術後也不能停用抗結核藥物，必須要完成療程；

總之整個結核的治療過程比較長，也需要家人的理解與關懷，共同戰勝疾病。