十二指腸潰瘍不難治療，目前臨床通常應用抑酸劑，即抑制胃酸分泌的藥物進行治療效果比較好。部分十二腸潰瘍患者通過藥物規範治療，潰瘍面會漸漸消失。

部分因十二指腸潰瘍穿孔到醫院就診的患者，需要外科手術干預，可以通過外科手術，比如腹腔鏡等，進行腹腔探查，明確十二腸潰瘍是否有穿孔。如果有穿孔會在腹腔鏡下對穿孔部位進行修補，修補完成後再進行內科治療。如果患者有上腹部不適，應儘早做相關檢查，包括胃鏡檢查。胃鏡檢查可以明確是否存在胃潰瘍、十二指腸潰瘍，如果有上述疾病，需儘早藥物治療效果比較好。