嬰兒進食母乳後腹瀉，需根據不同情況進行處理。嬰兒生後胃腸道功能發育未完善，母乳中乳糖酶消化較低、活性較弱，母乳餵養後易出現乳糖不耐受。攝入過多乳糖後，腸道內發酵，產酸、產氣增多，導致大便稀薄、次數增多，且大便易出現酸臭味。如果嬰兒正常母乳餵養，體重增長、發育情況良好，通常無需特殊處理，正常餵養即可，隨月齡增長腹瀉情況可明顯好轉。

如嬰幼兒母乳餵養後腹瀉較嚴重，導致生長、發育不良，可進行適當處理。如暫時更換無乳糖奶粉輔助腸道功能恢復，後逐漸轉為母乳餵養。母親飲食可進行一定程度迴避，減少過多甜食、水果及油膩食物攝入，可一定程度緩解嬰兒腹瀉現象。