直腸黏膜炎會癌變，但可能性非常低。通常情況下，單純炎症不會出現癌變，但黏膜出現其它低級別、高級別上皮內瘤變等癌前病變時，可能癌變。直腸黏膜炎在治療上主要是對症支持治療為主，若患者有腹瀉、大便次數增多，一定要用一些藥物來進行調理，平時應該注意飲食衛生，進食清淡、易消化食物，以免增加胃腸負擔。此外，生冷、刺激、油膩以及醃製食物儘量少吃，從而減少對腸道的刺激。

另外，直腸黏膜炎病人無論症狀是否緩解，都要定期進行腸鏡檢查。醫生建議50歲以上男性人群，尤其是有腫瘤家族史的病人，每年都要進行電子結腸鏡檢查，因為現在直腸癌病人發病率相對較高，應儘量做到早發現、早治療。