至今沒有證據顯示川崎病可以自愈，大部分川崎病都需要早期診斷，因為川崎病和感染性疾病容易混淆，都會出現發熱、皮疹、球結膜充血等，甚至部分患兒會出現呼吸道感染的症狀。患兒需要早期診斷，及時治療，川崎病治療的最佳窗口期是發病的5-7天，在此期間如果能及時給予丙種球蛋白、阿司匹林等聯合治療，絕大多數患兒能夠完全治癒。

患兒一旦出現川崎病相關表現，需要規範診斷和治療，需要跟其它的感染性疾病，甚至血管炎性疾病、類風溼性關節炎等全身疾病，或其它自身炎症性疾病進行鑑別，以免延誤診治，導致冠狀動脈瘤病變的發生，影響預後。