治療川崎病的藥物，目前全世界統一為丙種球蛋白加阿司匹林，兩者治療川崎病效果較好。急性期主張用大劑量丙種球蛋白進行衝擊治療，控制炎症效果，控制疾病進展，減少冠狀動脈瘤等嚴重併發症出現，同時服用中大劑量阿司匹林進行抗炎治療。如果患者體溫正常，炎症指標消退，無皮疹、眼睛紅、發燒等現象，複查血象，C反蛋白顯著下降。此時可以停用阿司匹林，改成小劑量阿司匹林抗凝治療，防止急性期出現冠狀動脈梗阻，抗血小板治療是川崎病治療的主要方法。

如果川崎病患者發生嚴重併發症，出現冠狀動脈瘤，此時不僅要服用阿司匹林，還要服用抗凝藥物，如華法林，維持國際標準化比值在2.0-3.0，防止形成血栓，導致急性心肌梗死發生。如果出現川崎病冠狀動脈瘤，同時存在明顯心臟增大，可以服用β受體阻滯劑，甚至降脂藥物、他汀類藥物。