不典型川崎病治療方案同典型川崎病相同，一線標準治療是大劑量丙種球蛋白聯合阿司匹林治療。但不典型川崎病，可能合併其他臟器或器官受累，可以有對症抗感染、臟器功能支持治療，具體如下：

1、以消化道出血為首發或主要表現，除川崎病丙種球蛋白治療之外，還應針對消化道出血進行治療；

2、以咽後壁膿腫為首發表現，除丙種球蛋白治療之外，還應進行局部抗感染治療；

3、神經系統受累，如以驚厥、抽搐或無菌性腦膜炎、面神經麻痺為主要表現，除丙種球蛋白聯合阿司匹林治療基礎上，還應進行營養腦神經、對症降顱壓、神經康復等治療。

總之，無論是不典型川崎病，還是典型川崎病，一旦診斷為川崎病，一線治療即為大劑量應用丙種球蛋白，如果沒有明確禁忌症，還要聯合口服阿司匹林治療。