肛門墜痛的原因往往都是因為局部的炎症刺激，一般是因為直腸下段，比如肛竇炎或者早期的膿腫都可以表現為肛門墜痛。除此之外，有些女性直腸前壁容易出現孤立性直腸潰瘍。孤立性直腸潰瘍往往都是因為用力排便反覆刺激、反覆摩擦，在直腸前壁靠陰道方向會出現比較大的潰瘍，表現為墜痛明顯。
這種情況下往往可能需要局部點藥緩解。另外需要改善排便情況。一般常用燻洗、坐浴緩解，使得肛門周圍的肌肉能夠放鬆，循環能夠改善，這樣墜脹疼痛的感覺會有明顯緩解。如果墜痛比較劇烈可以應用消炎鎮痛的栓劑，有時候可以用吲哚美辛栓等，能夠有很好的消炎鎮痛作用，但是不能長期應用。如果肛門直腸下段的潰瘍，比如潰瘍性直腸炎造成墜痛，也可以應用美沙拉秦栓或者美沙拉秦的灌腸液等治療。