巨結腸手術大部分可以治癒，但是巨結腸手術以後最常見的併發症主要有以下幾條：

1、汙糞：巨結腸孩子到年齡很大，甚至到小學生，內褲都是不乾淨，老有汙糞，肛門括約肌控制不好，所以導致汙糞；

2、頑固便秘：做完手術還是頑固便秘，儘管臨床上病變範圍已經完全切除，還是會出現便秘；

3、腸炎：經常便秘的孩子容易發生腸炎，往往是小腸結腸炎。

這是巨結腸術後比較常見的三種併發症，當然還有其他更嚴重的，比如大便失禁，控制不住，因為肛門口做了手術，括約肌發育不完善或者手術當中損傷比較大，所以術後控制方面就會差很多。