先天性巨結腸術後早期，出現漏便者大概佔30%-40%。情況有輕有重，輕者排稀便汙染內褲，重者可以在熟睡時有較多稀便排出，汙染被褥。有的患兒偶然發生，有的患兒經常發生。大部分患兒術後半年有所好轉，術後一年即可消失。晚期仍出現汙糞者佔大概20%，失禁者佔大概10%。這種情況主要是由於人體正常的排便是一個非常精密的過程，需要肛管的排便感受反射完整、內括約肌功能完整、腸道的蠕動功能正常，而先天性巨結腸手術需要切除病變的腸管，將剩餘腸管與肛門吻合，會破壞排便過程，所以容易引起汙糞甚至失禁。