先兆流產通常不會引起肚臍周圍疼痛，先兆流產可能會出現下腹隱痛、陣發性下腹痛，疼痛部位位於小腹正中，位置較低，而肚臍位置偏上。懷孕後受精卵在宮腔內種植、生長、發育，月經停閉、子宮增大，而子宮位於盆腔正中，增大的子宮壓迫盆腔時，小腹會感到隱隱作痛。發生先兆流產時由於剝離開母體的胚胎和血液刺激使子宮收縮，身體試圖排出胚胎及妊娠物而產生陣發性下腹部疼痛。

肚臍位於腹壁，在子宮前上方，肚臍周圍是腸管，臍周疼痛多為胃腸道功能紊亂、腸管痙攣、腸脹氣所致，一般伴有腹瀉、便秘等症狀，二者疼痛部位和疼痛原因均不同。但如果子宮和附件、腸管粘連在一起，如既往有盆腔炎症病史，先兆流產與臍周疼痛就會相互影響。此外，先兆流產可以與臍周疼痛症狀合併出現。