急性腸炎可分為感染性腸炎、細菌性腸炎、病毒性腸炎，寄生蟲引起的腸炎，藥物性引起的腸炎。如果是感染引起的腸炎首先要確定是哪一種病原菌感染，細菌感染可以用抗生素，如喹諾酮類、環丙沙星、左氧氟沙星等抗菌治療。同時因為腸炎經常會有大量腸液丟失，還要注意補充體液、多喝水，喝電解質如口服補液鹽或礦物質飲料等。另外還要注意休息，避免繼續吃能夠導致腹瀉的食物。還要注意清潔飲食，避免不潔飲食病史。

如果是藥物引起的腸炎，要停用有可能引起腹瀉的藥物。另外可以用止瀉對症的藥物，如蒙脫石散、黃連素等緩解症狀，一旦藥物停用以後腸炎很快會自愈。