性功能障分多層面，一般情況下性功能障礙是可以治療的疾病，並且部分患者是可以自愈的，針對性功能障礙的治療包括以下幾方面：
1、有基礎疾病：應該先治療基礎疾病，或者在治療基礎疾病的同時，結合性功能障礙的治療，如果長期糖尿病、高血壓，會直接影響到性功能，必須把血糖、血壓控制穩定的情況下同時去治療性功能障礙；
2、長期服用某些藥物：這種情況應該把所服的藥物暫停或更換其它藥物，如治療抑鬱症的藥物就可以直接導致性功能障礙；
3、患者年齡偏大：男性性腺功能減退，這種情況可以直接進行睪酮補充治療；
4、精神心理問題：應給予充分的心理疏導，或結合精神科協同治療；
5、解剖結構異常者：即尿道下裂，可以通過手術矯正；
6、無明確病因：應首先給予心理疏導，學習性生活方面的技巧，必要時可以採取藥物干預，特別是針對勃起功能障礙的患者。
如果採取各種方法都無法改善性功能，甚至無法勃起，可以採取陰莖假體植入進行治療。