患者HE4正常、CA12-5高，並不一定都是卵巢癌。由於HE4對卵巢癌的診斷特異性要高於CA12-5，較少在良性的婦科疾病中發現有HE4升高，而且HE4也不受月經週期的影響，因此能夠較好區別良性和惡性。但是HE4也並非全能，在部分已經確診的卵巢癌患者中，HE4並沒有明顯的升高。

CA12-5升高也不僅見於卵巢癌，還可以見於卵巢癌以外的其他惡性腫瘤，如子宮內膜癌、部分宮頸癌、乳腺癌、腸道系統的腫瘤等，患者都可以有CA12-5的升高。另外除惡性腫瘤外，在某些良性疾病中也可以檢測到CA12-5的升高，如子宮內膜異位症、子宮腺肌症、盆腔炎症、結核、胸水、腹水等，都可能有CA12-5的升高。因此單純的CA12-5升高，患者無需過於恐慌，可以通過醫生的體格檢查、B超、CT、核磁共振等影像學檢查，綜合判斷是否患有卵巢癌。

通常醫生會將CA12-5和HE4的數值，通過複雜的計算公式進行計算，得出Roma指數(羅馬指數)，Roma指數將患者分為絕經前和絕經後，通過不同的指標，有助於判斷患者是否有卵巢癌的可能。因此所有腫瘤學標記物都是一個輔助檢查，患者一定要結合影像學和腫瘤標記物，以及常規的查體，才能夠判斷患者是否患有卵巢癌，最終的病理診斷，才是最後的診斷標準。