美國CDC強調生殖器皰疹是不可治癒的終身性疾病，雖然臨床上的皮損可以自行痊癒，病程數天到2-3周不等，但皮損的癒合並不代表疾病的控制以及減少疾病的傳播和復發。

對於初發患者，抗病毒治療可以有效縮短病程，建議生殖器皰疹患者在疾病的發作期間和復發期間，需要藥物干預。即使生殖器皰疹的皮損可以自行痊癒，但仍然強調進行抑制性抗病毒治療和發作期抗病毒治療，對於預防疾病的復發和縮短病程有重要意義。