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兒童抽動症主要是根據抽動臨床發作特點診斷，抽動是指突然、無目的、快速、刻板的肌肉收縮，可以是身體一個部位或多個部位。抽動可以有自主意識，短暫控制住，但不自主情況下又會發生。睡眠無發作，發作時同步腦電圖無異常，一般會分為運動抽動和發聲抽 動。
小兒抽動症有自愈可能，因為抽動障礙本身分類包括短暫性抽動障礙，是指病程＜1年。很多輕症不主張藥物治療，即使中度或重症患者，慢性抽動障礙兒童也可能自愈。此類兒童通常在10-12歲時病情最嚴重，以後可能逐漸好轉。部分症狀在青春後期或成年早期消退，但部分 會終身存在。
需要鑑別兒童眨眼睛動作是否屬於抽動症，首先進行醫師面診，醫師可以詢問患者主觀感覺，簡單眼睛檢查，嘗試打斷兒童發作，讓兒童主觀控制發作判斷眨眼睛頻率、強度，醫生初步判斷屬於生理性還是病理性。同時可能會進行腦電圖檢查，判斷眨眼睛同時是否腦電圖有同步癲癇波發放，必要時會請眼科進一步檢查排除其它眼科疾病。
多動症和抽動症不是一個概念，但兩者存在緊密聯繫。多動症是一個整體行為控制問題，通常包括注意缺陷、多動、行為衝動。普通人群中發病率不到10%，有調查研究發現可能是2%-12%，但多動症在抽動症患者中發病率達到50%甚至以上。
抽動症是小孩常見的神經精神異常疾病，典型特徵是一系列肌群不由自主痙攣、收縮。判斷是否為抽動症主要看肌肉抽動是否符合抽動症的定義。在早期多數孩子的發病是從五官開始出現，如眨眼睛、按鼻子、嘴角抽動。之後逐步發展為軀幹部聳肩、甩頭，再進一步出現發聲異常，出現經常清嗓的表現，甚至開始不由自主說髒話，所以抽動症最早又稱為抽動穢語綜合徵。
孩子出現抽動症，也指抽動障礙，通常無論症狀輕重，均出現在清醒期，入睡後即會消失。而抽動障礙指孩子在清醒期出現的運動性抽動，比如肢體抽動、面部肌肉抽動。另外，孩子也可以出現發聲性抽動，比如清嗓子、咳嗽、大 口喘氣，或者發出各種奇怪的聲音。
多發性抽動症屬於神經精神疾病，並不會直接影響到消化道而使患者出現噁心、嘔吐。但是如果患者頻繁出現腹部肌肉抽動，如鼓肚子、抽肚子，或者頻繁發聲，可能會引起消化道不適。因此，如果此類患者出現明顯的消化道症狀，需要及時就醫，明確是否存在消化道疾病。