需要鑑別兒童眨眼睛動作是否屬於抽動症，首先進行醫師面診，醫師可以詢問患者主觀感覺，簡單眼睛檢查，嘗試打斷兒童發作，讓兒童主觀控制發作判斷眨眼睛頻率、強度，醫生初步判斷屬於生理性還是病理性。同時可能會進行腦電圖檢查，判斷眨眼睛同時是否腦電圖有同步癲癇波發放，必要時會請眼科進一步檢查排除其它眼科疾病。

最後需要綜合其它臨床症狀或體徵排除其它疾病，結合其它檢查結果綜合判斷。