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孤立性直腸潰瘍治療需要具體問題具體分析，若為單純孤立性直腸潰瘍，沒有明確病因且潰瘍面較小，不影響患者生活質量，可以使用康復新液、蒙脫石散、谷氨醯胺等藥物，同時局部可以進行灌腸或栓劑治療。若孤立性潰瘍有明確病因，如病毒、細菌感染，可以使用抗病毒或抗菌藥物治療。
瀰漫性小腸潰瘍病因目前尚不明確，可能原因有細菌、病毒感染，以及藥物性因素引起，還可以由腺瘤性息肉引起，具體如下：
空腸、迴腸多為小腸，瀰漫性空迴腸潰瘍即瀰漫性小腸潰瘍，瀰漫性小腸潰瘍可以表現為腹痛、腹瀉、貧血、消瘦、腹脹，嚴重時可以引起併發症，比如小腸穿孔、腸梗阻等。
腸鏡檢查時間多久因人而異，通常做腸鏡10分鐘左右即可完成。因為做腸鏡有技術要求，腸鏡到底後推鏡觀察時間要求不少於6分鐘，通過研究發現，只有保證充分的推進觀察時間，才可避免漏診，所以要保證在10左右分鐘結束腸鏡。
大部分病人均適合做無痛胃腸鏡檢查，沒有特別明顯的絕對禁忌症，但出現以下情況時需謹慎檢查：
腹痛常見原因有以下幾點：
直腸鏡檢查主要是檢查肛門以及直腸部位有無異常病變，如息肉、潰瘍、腫瘤等。直腸鏡為較硬、呈鋼管樣結構，長度約20cm，檢查時需要將肛門擴開，將直腸鏡深入直腸部分，會存在一定不適感。如果對肛門擴開過程能夠很好耐受，無明顯痛苦。若合併肛裂、痔瘡、肛周膿腫、肛門直腸癌或對肛門擴開十分敏 感者，可以存在明顯疼痛以及不適，但一般在能夠接受的範圍內。
腸鏡檢查前將飲用的電解質水吐出，首先需要排除患者是否對瀉藥如磷酸鈉鹽或複方聚乙二醇出現的過敏現象，若懷疑為過敏需要更換瀉藥，例如硫酸鎂、番瀉葉等。瀉藥被吐出後患者沒有有效攝入瀉藥，沒有達到清潔腸道的目的。首先需要再次購買瀉藥，可以選擇其它廠家品牌，在飲用時可以減慢速度，將藥物與水反覆交替飲用，還可以將電解質溶於無顏色飲料當中以改善口感。
胃黏膜腸化的診斷通常出現在體檢或就診後的活檢報告。腸化是胃黏膜壁被腸黏膜上皮替代變化的過程，分為輕度、中度、重度，與細胞異型增生並不相同。若胃黏膜出現異型增生，尤其是中重度異型增生、不典型增生，可能屬於早期癌變，需引起重視。臨床上一般將重度異型增生稱為高級別上皮內瘤變，即癌前病變。