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有時在超聲探查下，發現結節內有一定的鈣化，但良性的鈣化呈片狀或者團狀，惡性的鈣化呈砂礫樣或點狀鈣化。單純依靠鈣化判斷腫瘤的良惡性不科學，如果不能明確診斷，大多需進行穿刺活檢或手術切除，明確腫瘤的病理性質。如果是惡性腫瘤，應及時 進行甲狀腺切除，還應進行相應區域的淋巴結清掃，對於根治甲狀腺癌，提高手術治療效果有益。
甲狀腺結節手術以後，飲食的選擇與手術的方式、是否需要後續治療有關。對於食物的選擇，如果是甲狀腺功能亢進症患者，要減少含碘類食物的攝入，尤其是甲狀腺癌手術後，如需進行碘-131治療，應減少海帶、紫菜類含 碘食物的攝入，以減少碘劑對碘-131治療的影響。
甲狀腺結節4B惡性的可能性比較大，良性可能性比較小。甲狀腺結節4A是一個指標可能顯示惡性，甲狀腺結節4B是有兩個指標達到惡性，所以甲狀腺結節4B的惡性程度比較大。
甲狀腺B超發現甲狀腺結節縱橫比＞1，提示可能屬於惡性結節，但不代表一定是惡性。結節縱橫比＞1是通過臨床觀察切除的標本，可能會發現惡性結節，甲狀腺癌通常有此特點，所以才會在臨床B超報告上採用分級制度。
甲狀腺結節3級癌變幾率不是很大，多數是良性，少數可能轉為惡性，惡性比例在10%-30%。儘管甲狀腺結節3級癌變幾率不大，但畢竟在良性結節與惡性結節之間，因此需要提高警惕，定期進行檢查。
一旦發現甲狀腺的一些病變，比如甲狀腺結節，可以做手術切除。但要甄別這些結節是否有手術指徵，是否有必要把甲狀腺結節切除，建議患者一旦在查體或者就診過程當中發現了甲狀腺結節，不用特別緊張，並不是所有的甲狀腺結節，都需要手術切除。
甲狀腺結節檢查在臨床主要包括兩個科室，一個是內分泌科，另一個是外科。腫瘤醫院外科分多種外科，甲狀腺結節屬於頭頸外科。甲狀腺結節檢查主要是用B超，因為B超可以重複進行、費用比較低、對人體沒有傷害，更準確的檢查是B超引導下甲狀腺細針穿刺 ，但是因為屬於有創操作，只用在懷疑是甲狀腺癌的情況下，確診到底甲狀腺癌以及甲狀腺癌類型。
甲狀腺結節在做超聲進行診斷時，一般都會分成4個級別，級別越高，就代表著病變的嚴重程度越重。一般4a、4b的甲狀腺結節，都會懷疑有癌變的可能性，結節邊緣不清或血供豐富。分到4b類結節，應該及時做穿刺活檢，明確結節的性質是否能有癌變的可能。
甲狀腺結節診斷過程中，超聲檢查是常用手段。隨超聲器械不斷改進和提升，目前超聲可以發現甲狀腺或乳腺內小結節，甚至0.1cm左右結節均可被發現。對於甲狀腺結節分類，通過超聲可以對腫物大小、邊緣是否光滑，腫物內是否有鈣化、血運等情況，綜合判斷結節性質。