腎盂腎炎按照病程的長短可以分為急性腎盂腎炎和慢性腎盂腎炎。急性腎盂腎炎比較常見，一般敏感菌如大腸埃希菌等感染後，正規使用抗生素10到14天，約90%的患者可痊癒，仍不緩解的需要根據培養和藥敏結果來調整。慢性腎盂腎炎由於反覆長期的感染，通常已經出現腎盂蟲蝕樣改變等慢性化指證，有的是因為合併尿路梗阻等複雜因素，通常急性期按照急性腎盂腎炎治療，但易反覆。