新生兒敗血症會復發。敗血症是由各種病原體感染所致，在病原菌不明的情況下，療程至少3周，如果療程不足，停藥後很容易復發。另外新生兒患敗血症後並不會對本次所感染的病原菌產生終身免疫，有可能下次再次感染相同的病原菌或其他病原菌。預防復發，主要的措施是針對可疑的病原或已明確的病原選擇合適的藥物，同時療程要足，具體應聽醫生的指導。