腎積水自愈的可能性較小，僅限於少數疾病，如小的輸尿管結石。如果採用自行排石，結石排出後腎積水可緩解。腎積水主要是由於尿液從腎盂排除受阻，蓄積後生理壓力增高，腎盂伸展擴張，腎實質萎縮功能減退，腎積水的原因是輸尿管梗阻。
泌尿系統的梗阻，由於原發的病因和梗阻部位程度和時間長短不一，腎積水的臨床表現也不盡相同，有的時候可全無症狀。若併發感染，可出現急性腎盂腎炎症狀，如果積水時間較長，可能導致腎功能減退甚至腎衰，腎積水的治療就應當根據梗阻的病因、發病的緩急、梗阻的嚴重程度、有無併發症以及腎功能損害來綜合考慮。
腎積水時，尿路梗阻所在梗阻時間長短，對腎功能影響也起了關鍵作用，必須解除梗阻是治療的首要任務。如果病人病情危重，暫時無法解除梗阻，可以先引流尿液，在症狀緩解後，再解除梗阻。對於已經出現腎功能損害的，可以先行相關治療，如解除梗阻，同時輔助以血液透析等處理。