雙側腎臟積水如何進行治療需要區分不同情況，是功能性的雙側腎臟積水還是器質性雙側腎臟積水。功能性的雙側腎臟積水最常見於做膀胱B超的時候，或者做婦科彩超的時候，必須充分的充盈膀胱，女性在懷孕期間增大的子宮壓迫輸尿管，而出現的雙側腎臟積水，這時候使膀胱充分排空以後，或者分娩期以後子宮縮小，對腎臟或者輸尿管的壓迫消失，這種雙腎積水就會得到消失。
如果排除了以上的情況，就是腎臟或者輸尿管出現了阻礙，使尿液排出通道不暢，從而出現了雙側腎臟積水的情況，最常見的就是輸尿管的狹窄，不管是先天的還是後天性的，或者炎症、結石、腫瘤，造成了雙腎積水的存在，只有解除了這些原因，才能使雙側腎臟積水得到明顯的治療。