食管炎的症狀主要是胸骨後疼痛和胸骨後燒灼感，嚴重時出現吞嚥困難的症狀，部分患者可以有咽部異物感。最常見是反流性食管炎和黴菌性食管炎。反流性食管炎的症狀是上腹飽脹、反酸、噯氣、燒心，有時伴有嘔吐，胃鏡下可以發現食管下段條形糜爛。黴菌性食管炎的症狀，主要是胸骨後疼痛，進食時明顯，伴有吞嚥困難，內鏡下可以發現食管白色凝乳狀附著物，細胞刷檢可以找到黴菌孢子。