子宮內膜異位症多發生在子宮以外，最多見的是盆腔子宮內膜異位症、卵巢子宮內膜異位症。也就是在檢查時可以發現盆腔藍紫色結節，子宮後方有觸痛結節，卵巢可以發現巧克力囊腫等等。
而極少數人可以有遠方的異位，比如有人有週期性的鼻出血，經過檢查可以發現鼻部有子宮內膜異位結節，更少見的是肺部的子宮內膜異位結節。有些人可以出現週期性的氣胸，文獻報道週期性出現氣胸檢查可能發現子宮內膜異位。
當然如果子宮內膜異位到腸道，還會出現週期性的腸道的症狀，比如腹瀉、腹痛或者是便血、嘔血等現象，這些都是非常罕見的。而目前來講還沒有發現肩部的子宮內膜異位症，所以一般來講這種情況發生的可能性不大。