雌二醇低不一定是卵巢早衰，而且在月經週期的不同時段，雌二醇的水平不一定，雌二醇只有在排卵期前或者月經前會有一個小高峰。在來月經的時候查性激素，通常雌二醇水平不會很高，一般處於一個比較低的水平，這是正常情況。判斷卵巢早衰，主要是從促卵泡激素，也就是FSH的水平來判斷。卵巢早衰的診斷是需要年齡小於40歲，有停經史，比如六個月不來月經或者跟她的月經週期相比三個週期沒有來。再就是促卵泡激素，隔12周，也就是三個月以後兩次檢查都是大於40，同時年齡小於40歲，就可以診斷卵巢早衰。
單純的雌二醇低不能診斷卵巢早衰。而對於卵巢早衰來講，首先要看目前有沒有症狀，然後要用雌孕激素補充，主要的目的是緩解目前的不適症狀，預防遠期有可能出現的骨質疏鬆、心血管疾病的風險，甚至於老年痴呆的風險，要降低這些風險。