男性不育的檢查內容包括生殖器官的體檢、化驗室檢查和必要的影像學檢查。生殖器官的體檢主要是檢查男性外生殖器官發育是否正常，有沒有睪丸發育不良、隱睪、精索靜脈曲張等男性生殖系統的疾病。男性不育的化驗檢查主要圍繞著精子的化驗項目開展，最基本的檢查項目包括精液分析和精子形態學分析，這是男性不育最基礎的檢查。有條件的醫院還開展了精漿生化、精漿彈性蛋白酶、支原體、衣原體檢測等等。根據檢查結果，有些人可能還需要增加一些檢測項目，比如內分泌檢查也就是性激素水平、男性Y染色體微缺失檢查，有些人還需要做染色體檢測。有些患者還需要做一些影像學檢查，通過B超、X線、CT、甚至磁共振檢查，來對一些疾病進行確診，以明確病因。