寶寶臉上長咖啡斑一般來說需要到醫院進行相應的治療，可以是物理的治療方法，像冷凍、磨削或者切除等傳統的治療手段，可以讓寶寶的咖啡斑得到改善。還可以用激光治療或者強脈衝光進行治療，對寶寶的咖啡斑都會有一個治療效果。但是不同的治療方法也會有不同的損傷，有可能會出現瘢痕或者皮膚異常，一定要在正規醫院進行選擇性的治療。
當然寶寶的咖啡斑如果是其它疾病伴發的，像神經纖維瘤病、豹皮綜合徵或者範可尼貧血，還有共濟失調-毛細血管擴張症等等，可能伴發咖啡斑，一定要及時對原發疾病進行治療，寶寶臉上的咖啡斑才可能有所緩解。