多發性硬化症是一種由免疫異常引起的自身免疫性疾病，主要與細胞免疫有關。目前病因尚不完全清楚，考慮免疫是重要的因素，患者可能有病毒感染史。
也有研究表明，多發性硬化症的發病可能有遺傳因素，是多基因遺傳，父母患多發性硬化症，兒童患病的概率高於一般人群。環境因素也很重要，高寒地區人群發病率較高。綜上所述，多發性硬化的病因尚不完全清楚，但主要是由免疫異常所引起。