格林巴利綜合徵發病情況不同，預後也不同。可分為急性發病、亞急性發病和慢性複發性起病。急性和亞急性發病者85％，在1-3年完全恢復，約10％的患者遺留有長期後遺症。老年患者、有嚴重神經軸突變性、輔助呼吸時間超過1個月，或進展快且伴有嚴重自主神經功能者預後不良。約3％的患者可能出現1次以上的復發，復發間隔時間可數月至數十年。