格林-巴利綜合徵是一種自身免疫性疾病。
免疫抑制治療主要用於急性期，首選丙種球蛋白。如果患者沒有丙種球蛋白過敏史，或先天性IgA缺乏症和其他禁忌症，可以使用這種方法。關於激素治療，國外的一些臨床試驗已經證實，單用糖皮質激素並不是很有效。
由於我國經濟和醫療條件的限制，一些患者不能接受丙種球蛋白或血漿置換治療。部分醫院還使用糖皮質激素治療格林-巴利綜合徵，療效有待進一步探討。
急性期還可給予大量的B族維生素、維生素C等。對於呼吸困難的患者，應早期氣管插管，呼吸機輔助呼吸，並提倡對患者進行早期康復治療。