肺血栓全稱為肺血栓栓塞症，是指由血栓引起的肺栓塞。肺栓塞是指全身靜脈系統的栓子，經靜脈系統迴流到右心，然後進入肺動脈阻塞肺動脈系統而引起，以肺循環障礙為基礎的一系列臨床病理、生理綜合徵。
另外，栓子除血栓外，還可以是脂肪栓子、羊水、腫瘤、空氣等等，在這些原因當中血栓最常見，佔比可達95%。一般情況下血栓栓子來自於靜脈系統或者右心，主要表現是肺循環障礙、右心功能障礙和呼吸功能障礙。肺動脈血栓發生栓塞後，由於肺組織有肺動脈和支氣管動脈雙重供氧，一般不發生完全缺氧性壞死。引起肺栓塞的血栓90%是來自於靜脈血栓，以下肢深靜脈血栓最為多見。