感染一般不會引起肺栓塞，感染主要是由於細菌，或者病毒等其他微生物導致炎症反應。肺栓塞主要是凝血機制障礙在肺內形成栓子，或者來源於身體其他部分的栓子脫落，進入肺動脈引起栓塞，主要是下肢深靜脈血栓脫落進入肺循環。
感染一般不會在肺內形成栓子，但是肺栓塞可以同時合併感染存在。出現肺栓塞在溶栓治療的同時，需要進行抗感染治療。