慢性阻塞性肺疾病會出現很多的併發症。在急性加重時，呼吸困難症狀明顯加重，發生低氧血癥，或者合併有高碳酸血癥，或具有缺氧和二氧化碳瀦留的臨床表現，出現了慢性呼吸衰竭；自發性氣胸；缺氧引起肺血管床的減少，以及缺氧導致肺動脈痙攣，血管重塑，導致肺動脈高壓，右心室肥厚擴張，最後形成右心功能不全，而導致慢性肺源性心臟病；胃潰瘍；睡眠呼吸障礙；繼發性紅細胞增多症。