耳內鏡微創術後應注意保持手術耳朵乾燥清潔，避免發生汙染引起耳部感染。不同類型手術的注意事項不同，若患者病情較輕，手術範圍較小，只需注意避免耳部感染，如果沒有耳痛、流膿、發燒等現象出現，無需特殊注意正常生活即可；如果耳膜穿孔較為嚴重，手術範圍較大，需要取自身軟骨進行鼓膜修復，則需避免感冒、劇烈咳嗽和長時間乘坐飛機等。