反流性食管炎的癌變幾率較低，患者通過規範性的藥物治療，一般都可以得到緩解。但是如果患者症狀較重，如燒心、反酸的症狀嚴重，甚至晚上睡覺也有症狀，且時間較長，如數年、數幾年都有症狀，此時應提高警惕。反流性食管炎多由膽道功能較差或者切除膽囊、幽門開口屏障功能喪失等引發，部分慢性胃炎導致胃排空障礙，出現胃酸反流也會導致此疾病。

患者食道下端的黏膜由於長期受到胃酸，或者膽汁的刺激，可先出現炎症，逐漸發生不典型增生，比如巴雷特食管炎。因此，如果長期反流引發巴雷特食管炎時，患者應提高警惕，因為此情況癌變幾率比普通人群要高。但是患者確診巴雷特食管炎，應避免驚慌，通過規範的藥物治療，也可降低癌變幾率。