通常建議食管炎患者一年複查一次，如食管炎較為嚴重，建議六個月複查一次，Barrett食管三個月複查一次。食管炎患者如果食管內無明顯潰瘍以及其它情況，一般一年複查一次胃鏡。通常正規治療8-12周以後，按需治療，即出現症狀時再服藥。

若存在上述症狀的患者無新發症狀，如突然胸痛、嘔血、消瘦、發燒，可以一年複查一次胃鏡。但如在診斷反流性食管炎時有潰瘍形成，且做過活檢，比如存在腸化或者有異型增生，約需半年複查一次胃鏡。食管炎存在比較特殊類型，即Barrett食管。Barrett食管即食管上方覆蓋來自於其它部位的化生上皮，較容易癌變，建議每三個月複查一次。