食管炎患者應該於消化內科就診，食管炎患者存在很多食管外表現，比如反酸、胸痛患者，可去消化內科就診。如果出現反覆胸痛，部分人會去心內科就診，心內科醫生會對患者做心電圖或者動態心電圖，甚至做冠脈造影檢查，排除心臟疾病。

除此之外，患者也可於消化內科就診。部分患者會出現反流性咳嗽，因此會去呼吸科就診，此類患者夜間咳嗽明顯，可通過胸部CT排除呼吸系統疾病，如排除後，可診斷為反流性咳嗽，與胃食管反流有關。還有部分患者因為慢性咽炎去五官科就診，經過動態喉鏡檢查後，可能明確為胃食管反流導致，應就診於消化內科。