扁桃體摘除是否疼痛因情況而異，目前扁桃體摘除術主要分為全身麻醉與局部麻醉。小兒多使用全身麻醉，而成人主要以局部麻醉為主。如果選擇全身麻醉，術中患者不會感覺到疼痛。

若選擇局部麻醉，疼痛一方面需要根據術者給予麻藥是否到位、術者經驗和術中的技巧判斷，另一方面個人耐受度並不相同，所以選擇何種麻醉方式因人而異，根據患者個人情況決定局麻或全麻，因此進行扁桃體切除手術，建議患者到正規醫院進行檢查、治療。