扁桃體是人體呼吸道的第一道門戶，兒童扁桃體發炎實際是由於各種病原體感染，包括細菌、病毒和支原體等病原體感染引起。扁桃體跟上述病原體做鬥爭時，就會腫大、充血，從而引發扁桃體炎，扁桃體炎也是身體跟病菌、病毒等抗爭的一種方式。

輕度扁桃體炎有自限性，毒力不太大時，扁桃體可能會把這些病毒細菌消滅。如果扁桃體炎比較嚴重，病原體毒力強大，數量又多，可能扁桃體發炎程度很重，扁桃體腫大甚至出現化膿，這時需要用藥物治療，否則會進一步向下發展為下呼吸道感染，氣管炎、肺炎等，對孩子危害更大。