強直性脊柱炎的發病起始部位在骶髂關節，也就是平常說的臀部。病人會表現為臀部兩側疼痛，出現交替性疼痛，早晨起來疼的更嚴重，因此在核磁共振上主要是表現為骶髂關節炎。

在核磁上可以看到病人骶髂關節的骶骨或者髂骨出現骨髓水腫，也就是在T2像上會出現發白、信號增強。在骶髂關節之間會出現積液，也就是在核磁共振的T2像、T2壓脂像上會出現發亮、發白、信號增強，這就是強直性脊柱炎最早期的骶髂關節炎表現。進一步會出現骨質鈣化，也就是韌帶鈣化，此時可以看到有骨贅形成。